Страница 3 из 3 ПерваяПервая 123
Показано с 21 по 28 из 28

Тема: ДНК ископаемого человека

  1. #21
    admin Аватар для dt52
    Регистрация
    27.05.2005
    Сообщений
    17,819
    Поблагодарил(а)
    674
    Получено благодарностей: 383 (сообщений: 282).
    ДНК данных нет?
    Contra factum non est argumentum

  2. #22
    Постоялец
    Регистрация
    20.01.2014
    Сообщений
    650
    Поблагодарил(а)
    25
    Получено благодарностей: 286 (сообщений: 189).
    Цитата Сообщение от dt52 Посмотреть сообщение
    ДНК данных нет?
    Пока нет,но думаю,что на Западе за этим дело не станет.

  3. #23
    Постоялец
    Регистрация
    20.01.2014
    Сообщений
    650
    Поблагодарил(а)
    25
    Получено благодарностей: 286 (сообщений: 189).
    Ученые расшифровали древнейшую ДНК человека
    Немецким ученым удалось расшифровать ДНК, извлеченную из окаменелостей возрастом 300-400 тысяч лет — древнейшую ядерную ДНК предков человека. Результаты анализа указали на то, что предки Homo sapiens очень давно отделились от предков неандертальцев и денисовцев в самостоятельный вид. О своем открытии палеогенетики рассказали на конференции Европейского общества по изучению эволюции человека, а коротко о нем сообщает Science News.

    Обнаруженные в знаменитом испанском могильнике Расщелина костей (Sima de los Huesos) в горах Сьерра-де-Атапуэрка кости испанские ученые изначально классифицировали как относящиеся к гейдельбергскому человеку (жил в Евразии от 600 до 250 тысяч лет назад). Этот вид считается предком неандертальцев, а некоторые исследователи относят его к предкам и современных людей. Однако в 2013 году митохондриальная ДНК (мтДНК) останков показала много общего с мтДНК денисовцев — другого вида людей, о которых антропологам почти ничего не известно.
    В последующие годы палеогенетики из Германии пытались секвенировать ядерную ДНК. Им удалось извлечь достаточно материала из зуба и одной из костей ноги — несмотря на то, что древняя ДНК разложилась на короткие фрагменты (от 25 до 40 пар оснований). Хотя ученые не смогли полностью секвенировать геномы по останкам, им удалось добыть информацию об одном-двух миллионах пар.

    Эту ДНК Маттиас Майер (Matthias Meyer) и его коллеги из Института эволюционной антропологии имени Макса Планка просканировали на предмет уникальных маркеров неандертальцев, денисовцев и современных людей, и обнаружили, что в останках из Расщелины костей куда больше неандертальских аллелей первых, чем денисовских или от Homo sapiens.

    Это означает, что предки неандертальского человека отделились от основного ствола Homo (в том числе денисовцев) очень рано (хотя при позднейших контактах имели место ограниченные случаи скрещивания). Кроме того, Майер заявил, что предки Homo sapiens разошлись с предтечами неандертальцев и денисовцев между 550-м и 765-м тысячелетием назад — это от 100 до 400 тысяч лет раньше, чем думали ученые. Столь древнее выделение предков человека разумного в отдельную группу заставляет пересмотреть современные представления об эволюции человека и расселения его по планете. http://lenta.ru/news/2015/09/14/simadna/

  4. #24
    Постоялец
    Регистрация
    20.01.2014
    Сообщений
    650
    Поблагодарил(а)
    25
    Получено благодарностей: 286 (сообщений: 189).
    Третий вид людей поселился в алтайских пещерах 170 000 лет назад



    Ученые установили, что так называемые денисовцы, которых считают третьим видом людей, впервые появились на Алтае не 50 000 лет назад, как считалось раньше, а 170 000. Определить это генетикам помогли новейшие находки.

    Ранее в Денисовой пещере были найдены останки девочки, жившей здесь десятки тысяч лет назад. Тогда ученые нашли кость фаланги пальца и два коренных зуба. Теперь в более поздних слоях грунта исследователи обнаружили новые останки — денисовцев, живших задолго до этой девочки.
    Были найдены три зуба: два коренных и один молочный, — принадлежащие двум мужчинам и одной женщине. В молочном зубе сохранилось достаточное количество ДНК, чтобы определить возраст его обладателя. Выяснилось, что соседи неандертальцев и кроманьонцев появились в этой местности около 170 000 лет назад и прожили там порядка 65 000 лет, прежде чем исчезнуть с лица Земли.
    Также исследователи определили, что денисовцы, жившие в этой местности в разные эпохи, не являлись друг другу родственниками: это говорит о том, что пещера заселялась третьим видом людей несколько раз за 100 000 — 170 000 лет. То, что денисовцы жили на Земле так долго, в свою очередь, позволяет говорить о том, что это действительно был самостоятельный вид человека, не состоявший в родстве с неандертальцами. В пользу этой гипотезы также говорит то, что ранние денисовцы отличались от неандертальцев в той же степени, что и их потомки, пишет Science Magazine.
    Теперь, чтобы статус денисовцев как третьего вида людей был окончательно закреплен за ними, необходимо найти большее количество их останков. Сейчас исследователи работают над этим. http://www.moya-planeta.ru/news/view...t_nazad_14737/

  5. #25
    Постоялец
    Регистрация
    20.01.2014
    Сообщений
    650
    Поблагодарил(а)
    25
    Получено благодарностей: 286 (сообщений: 189).
    Мужские гены сохранили расовую чистоту



    Группа ученых из Стэнфордского университета обнаружили, что, несмотря на присутствие неандертальских генов в геноме современного человека, они совершенно отсутствуют в половой Y-хромосоме. Скорее всего, человеческие женщины могли рожать от неандертальцев только дочерей, поскольку зародыши мужского пола не приживались. Результаты исследования опубликованы в American Journal of Human Genetics. Пресс-релиз доступен на сайте EurekAlert!

    ДНК современного человека включает в себя 2,5-4 процентов генов, унаследованных от неандертальцев в результате скрещиваний между Homo sapens и Homo neanderthalensis примерно 50-100 тысяч лет назад. Это удалось установить благодаря сравнению геномов человека и неандертальца; полный набор ДНК последнего был получен из сохранившихся костей, чей возраст достигал 38-70 тысяч лет. ДНК обоих видов оказалось идентично примерно на 99,7 процентов.

    Воспользовавшись банками данных геномных последовательностей, ученые впервые проанализировали ДНК в Y-хромосоме человека и выяснили, что какие-либо следы неандертальского генома в ней отсутствуют. Специалисты объясняют это тем, что гены вымерших людей могли быть несовместимыми с другими человеческими генами, что располагались на половой хромосоме.
    Несколько генов неандертальcкой Y-хромосомы являлись частью иммунной системы. Три из них представляют собой антигены гистосовместимости, напоминающие человеческие лейкоцитарные антигены, с помощью которых трансплантологи обычно проверяют совместимость тканей доноров и реципиентов при пересадке органов.

    По словам ученых, иммунная система женщины могла атаковать плод мужского пола, если последний нес в себе Y-хромосому с неандертальскими антигенами гистосовместимости. Таким образом, постоянные выкидыши могут объяснить, почему ни один ген H. neanderthalensis не перекочевал в мужскую половую хромосому современных людей.

    Анализ Y-хромосом людей и неандертальцев также позволил уточнить время, когда эти два вида рода Homo произошли от единого предка: примерно 550 тысяч лет назад. Предыдущие исследования оценивали возраст расхождения древних людей в 400-800 тысяч лет.
    https://lenta.ru/news/2016/04/07/neanderthalensis/

  6. #26
    Постоялец
    Регистрация
    20.01.2014
    Сообщений
    650
    Поблагодарил(а)
    25
    Получено благодарностей: 286 (сообщений: 189).
    Современные люди появились более 300 тысяч лет назад, заявляют ученые
    МОСКВА, 28 сен – РИА Новости. "Воскрешение" ДНК древних людей из Южной Африки показало, что первые люди современного типа появились на Земле больше 300 тысяч лет назад, задолго до их исхода из Африки, говорится в статье, опубликованной в журнале Science.
    "Наше открытие показывает, что и генетические, и палеоантропологические данные свидетельствуют о том, что родиной человечества является не какая-то одна конкретная точка в Африке, а весь континент в целом. Скорее всего, Homo sapiens появились в результате обмена генами сразу между несколькими группами древних людей", — рассказывает Карина Шлебуш (Carina Schlebusch) из университета Упсалы (Швеция).
    До недавнего времени антропологи и палеонтологи считали, что современный человек, Homo sapiens, возник в Восточной Африке примерно 200 тысяч лет назад, через несколько сотен тысяч лет после разделения предков неандертальцев и кроманьонцев. Первые люди, как показывали раскопки, проникли на Ближний Восток примерно 70 тысяч лет назад, а в Европу – около 45 тысяч лет назад.
    С другой стороны, находки последних лет и генетические исследования говорят о том, что люди могли покинуть Африку гораздо раньше, как минимум 130 тысяч лет назад, и контактировать с неандертальцами на протяжении долгого времени. В подтверждение этого ученые недавно нашли в Марокко останки Homo sapiens, живших в Африке примерно 300 тысяч лет назад.
    Вдобавок, на роль прародины человечества сегодня так же претендует и Южная Африка, в пещерах которой ученые недавно нашли кроманьонские орудия труда возрастом в 150 тысяч лет и останки Homo naledi, потенциальных предков человека, живших в пещере Наледи около 330 тысяч лет назад.
    Шлебуш и ее коллеги уже несколько лет изучают ДНК самых древних народов Африки, так называемых койсанцев, чьи племена живут на территории пустыни Калахари в ЮАР. Недавно их коллеги открыли семь скелетов древних жителей Южной Африки, чей возраст составляет примерно 2-3 тысячи лет, что натолкнуло Шлебуш на мысль попытаться извлечь их ДНК и сравнить ее с устройством генома койсанских народов.
    Сравнивая число мелких мутаций в ДНК древних африканцев и их самых близких родичей, ученые надеялись вычислить точную скорость накопления "опечаток" в геноме человека и вычислить ту точку, когда жил общий предок все народов мира и первый настоящий человек Земли.
    Климат юга Африки не пощадил останки древних людей, и ученым в большинстве случаев удалось восстановить лишь часть генома, в том числе их Y-хромосому и митохондриальную ДНК – геном митохондрий, клеточных "энергостанций", передающихся от матери к ее потомоству.
    Этого, с другой стороны, хватило для того, чтобы подтвердить, что древние жители ЮАР были прямыми родичами койсанских народов, удалить более "новую" ДНК из их геномов и вычислить скорость эволюции человечества.
    Как оказалось, общие предки койсанцев и остальных народов Земли жили в Южной Африке не 120 тысяч лет назад, как показывали прошлые исследования Шлебуш и ее коллег, а 260-350 тысяч лет назад. Подобный сценарий, как отмечают ученые, является очередным аргументом в пользу теории "африканских садов Эдема" – идеи о том, что человечество возникло не в одной точке, а эволюционировало на всем африканском континенте.


    РИА Новости https://ria.ru/science/20170928/1505787196.html

  7. #27
    Постоялец
    Регистрация
    20.01.2014
    Сообщений
    650
    Поблагодарил(а)
    25
    Получено благодарностей: 286 (сообщений: 189).
    Сунгирь: мальчик… и еще мальчик!

    Палеогенетики сумели прочитать геномы четверых человек из палеолитической стоянки Сунгирь во Владимирской области, включая останки из знаменитого парного захоронения детей. И результат оказался неожиданным. С момента открытия этого захоронения одного из детей считали, по внешним признакам скелета, девочкой. На этом порою даже строили интерпретации погребального инвентаря и пытались реконструировать религиозные воззрения людей палеолита. Но останки, известные как «Сунгирь-3», оказались принадлежавшими мальчику – в них имеется Y-хромосома. Оба мальчика из парного погребения приходятся друг другу, скорее всего, двоюродными или троюродными братьями.

    Исследование провел большой коллектив ученых из Дании, Швейцарии, США, Германии, Великобритании, Армении и Франции. Россию в этой команде представляли сотрудники Центра физической антропологии Института этнологии и антропологии РАН и кафедры антропологии биологического факультета МГУ. Уточнение пола «Сунгирь-3», конечно, не единственный вывод, сделанный исследователями. Результаты их работы опубликованы в статье в журнале Science, также ожидается выход еще одной статьи в Nature.

    Мы кратко расскажем об истории открытия сунгирской палеолитической стоянки и о результатах новых исследований. Сунгирь – это маленькая речка, даже, скорее, ручей. Длина его всего шесть километров. На окраине Владимира он впадает в Клязьму. Как раз возле места впадения в 1955 году был карьер, где добывали глину. И однажды ковш экскаватора вместе с глиной извлек из земли какие-то кости. За дальнейшее мы должны поблагодарить экскаваторщика А. Наровчатова: он собрал кости и отнес их во владимирский краеведческий музей. Там специалисты поняли, что находка представляет интерес, и археологи Астахов и Черных провели раскопки на участке. Вскоре стало ясно, глину придется добывать в другом месте: ученые нашли стоянку эпохи верхнего палеолита, то есть возрастом более 20 тысяч лет. Со следующего года в течение более чем 20 лет раскопки на Сунгирской стоянке вела экспедиция под руководством Отто Бадера из Института археологии АН СССР.

    Археологические исследования в этом районе продолжаются и в наши дни. Всего раскопано более 4500 квадратных метров. Возраст сунгирской стоянки, по последним данным, составляет 34-36 тысяч лет. Причем люди там жили непрерывно в течение длительного времени или хотя бы постоянно посещали это место. Ученые предполагают, что население Сунгирской стоянки не превышало единовременно 50 человек.

    Но и само по себе обнаружение палеолитического поселения не сделало бы речку Сунгирь всемирно известной. О ней бы знали лишь узкие специалисты. События, которые принесли ей подлинную славу, начались в 1964 году. Сначала был найден череп. Вызванный срочной телеграммой из Москвы академик Михаил Герасимов принял участие в извлечении черепа из земли, а потом увез его, чтобы сделать скульптурный портрет человека эпохи палеолита. Но вскоре пришлось вернуться: археологи сообщили, что нашли еще один череп. Быстро выяснилось, что это не одиночный череп, а полный скелет человека, погребенного тысячи лет назад. Всего же на Сунгирской стоянке было найдено шесть скелетов, череп, бедренная кость и обломок еще одной кости.

    Наиболее известны три скелета, получившие в научной литературе безликие наименования Сунгирь-1 (это он был найден в 1964 году), Сунгирь-2 и Сунгирь-3 (найдены в 1969 году). На самом деле Сунгирь-1 – это взрослый мужчина, 55 – 57 лет, высокий и широкоплечий, а Сунгирь-2 и Сунгирь-3 – дети, 12 и 9-11 лет, младший из них до недавнего момента считался девочкой.

    Самое важное, что эти люди были обнаружены в неповрежденных погребениях с богатым инвентарем, который дал нам уникальный шанс немного приоткрыть тайну ритуалов людей палеолита. Правда, каждая новая деталь вызывает еще больше новых вопросов.

    Все погребенные лежат вытянувшись на спине. Дети были похоронены одновременно и ориентированы головами друг к другу. Тела всех троих были перед погребением покрыты красной охрой. На всех телах ученые увидели мелкие, по полсантиметра длиной, бусинки из бивня мамонта или зубов животных. Эти бусинки располагались линиями, одна за другой. Линии шли поперек туловища, по бокам, вдоль и поперек рук и ног. Стало понятно, что когда-то они были нашиты на одежду, которая не сохранилась. Археологи даже сумели реконструировать внешний вид этой одежды, которая напоминала костюм народов Севера: рубаха и соединенные с обувью штаны из шкур. У мужчины и старшего мальчика были шапки, расшитые бусами из бивня мамонта и клыков песца. У младшего мальчика (которого до недавнего времени считали девочкой) – что-то вроде капюшона или головной повязки.
    Неожиданный предмет, явно отражающий неизвестный нам погребальный ритуал, был найден в захоронении детей. Под левой рукой старшего мальчика лежал явно искусственно обработанный фрагмент левой бедренной кости взрослого человека. Возле рта мальчика и на его животе лежали кости пещерного льва.

    У мужчины имелись кремневый нож и скребло. У старшего мальчика один кремневый нож был в правой руке, а второй лежал в ногах. У младшего было два больших кинжала из бивней, длиной более 40 сантиметров. Рядом с телами детей лежали два копья и дротики, сделанные из бивней мамонта. Длина большого копья 2,4 метра, второго – 1,6 метра. Копья представляют собой самую большую загадку Сунгирской стоянки. Ее обитатели владели секретом выпрямления мамонтовых бивней. Как они это делали, непонятно до сих пор.

    Помимо оружия рядом с телом старшего мальчика лежала отшлифованная пластинка из бивня мамонта, искусно вырезанная в форме лошади. Некоторая «горбоносость» фигурки заставляет ученых предполагать, что это не лошадь, а сайгак. Другая фигурка «лошади-сайгака», сделанная более условно, лежала у него на груди. В ней было проделано отверстия, за которое она крепилась к одежде. У левого плеча мальчика нашлась еще одна пластинка, на этот раз в форме мамонта. Некоторые исследователи предполагают, что и лошадь, и мамонт были родовыми тотемами, и мальчик мог принадлежать, например, к материнскому роду лошади и к отцовскому роду мамонта.

    Другие интересные предметы получили названия «прорезные диски». Это тоже пластинки из бивня мамонта, круглой формы, в которых прорезаны отверстия: одно в центре и от четырех до десяти радиально. В результате диск напоминает колесо с отверстием для оси и спицами. Диаметр дисков от 3 до 10 сантиметров. Примечательно, что из четырех дисков три лежали у тела младшего мальчика: на животе, над головой и у правого виска. Еще один диск лежал у правого виска старшего мальчика. Один из дисков младшего был надет на кончик дротика, диск старшего тоже предположительно был надет на деревянное копье (оно не сохранилось, но диск был припаян известью в вертикальном положении). Что это за диски? Возможно, диски изображают Солнце или Луну, которые почитались этими людьми. Или диск, надетый на копье, напоминает инструмент для добывания огня и поэтому символизирует огонь.

    Не меньше споров вызвали предметы, которым археологи дали названия «жезлы начальника» или «выпрямители древков» (подробнее об этом типе палеолитических артефактов, в том числе и об интерпретации сунгирских находок, можно прочитать в особом очерке). Все они находились возле младшего из детей. Это жезлы, длиной от 11 до 26 сантиметров, с расширенной верхней частью, в которой проделано сквозное круглое отверстие. На одном жезле отверстие окружает орнамент из точек. Два жезла сделаны из бивня мамонта, два – из рогов северного оленя.

    Всего же на Сунгирской стоянке было найдено более 70 тысяч предметов. Среди них орудия из камня, кости, рога, бивня мамонта. Среди украшений есть раковины с проделанными в них отверстиями, подвеска из окаменевшего моллюска белемнита («чертова пальца»), множество подвесок из зубов хищных животных. Бадер обнаружил следы шести жилищ типа шалашей. Они были довольно велики, по 10 – 15 метров длиной. В каждом из них был очаг. В поселении были отведены особые места, где люди занимались обработкой камня и костей.

    Ученые нашли и многочисленные кости животных, которые служили пищей обитателям Сунгирской стоянки. Особенно много костей мамонта, песца, северного оленя, древнего вида лошади, а также есть кости бизона, сайгака, бурого медведя, росомахи, пещерного льва, волка, зайца-беляка, тетерева, серебристой чайки и лемминга. По останкам пыльцы определили, что в ту эпоху вокруг рос хвойный лес из ели и сосны, имелись также береза и ольха.

    В 2014 году вышла монография The People of Sunghir. Burials, Bodies, and Behavior in the Earlier Upper Paleolithic, авторами которой стали специалисты по археологии и антропологии Эрик Тринкаус (Университет Вашингтона в Сент-Луисе), Александра Бужилова (НИИ и музей антропологии МГУ имени М. В. Ломоносова), Мария Медникова и Мария Добровольская (Институт археологии РАН). В ней сообщается целый ряд новых сведений о сунгирцах, полученных после подробного исследования их костей. В частности установлено, что мужчина (Сунгирь-1) долго занимался тяжелой работой, он мог раскалывать кости или камни. Старший из детей проводил долгое время сидя на корточках, младший подолгу сидел на коленях и крутил что-то правой рукой. Может быть, он вил веревки или обминал кожаные ремни (по одной из версий, именно такова была функция «просверленных жезлов», имевшихся у сунгирцев). Также, если судить по форме костей головы, младший из детей часто переносил грузы на голове.

    Мужчина и старший из мальчиков были убиты. На левой подвздошной кости мальчика ученые обнаружили отметину – вероятный след от удара в живот каменным кинжалом или копьем. Мужчина был убит стрелой, попавшей в сонную артерию. Ее след остался на позвоночнике. Стрелок при этом находился выше, чем жертва, вероятно, стоял на вершине холма.

    Установлено также, что рацион сунгирцев был разным. Мужчина и один из мальчиков ели достаточно много мяса и рыбы, а вот основным источником белка для другого мальчика служили, как ни странно, насекомые. Может быть, сидя на корточках, он как раз занимался их поиском. Такой же диеты придерживался, кстати, человек, бедренная кость которого лежала рядом с мальчиком.

    Первые генетические исследования сунгирских останков были проведены в начале XXI века, когда удалось выделить митохондриальную ДНК. В результате удалось подтвердить, что дети приходились друг другу родственниками (как тогда полагали, братом и сестрой). В нынешнем исследовании как митохондриальные, так и ядерные геномы, что собственно и позволило правильно определить пол младшего из детей. Кроме обоих мальчиков, геномы были выделены из костей взрослого мужчины (Сунгирь-1) и бедренной кости, лежавшей возле старшего мальчика (Сунгирь-4). Кость тоже оказалась мужской.

    Все четверо принадлежат к митохондриальной гаплогруппе U (мужчина Сунгирь-1 – к субкладе U8c, остальные – к U2). Y-хромосомная гаплогруппа у всех четверых совпадает – C1a2. Как выяснилось, близкими родственниками друг другу никто из погребенных не был. В частности, дети не были родными братьями, но могли быть двоюродными или троюродными. Не исключено, что бедренная кость, лежавшая рядом со старшим из мальчиков, принадлежит его прапрадедушке или более далекому предку. Вспомнив, что оба они соблюдали довольно необычные ограничения в питании, можно предположить, что оба выполняли среди соплеменников какую-то особую, возможно, сакральную функцию, например, были жрецами или шаманами.

    Интересно, что геномы указывают на тесную связь обитателей сунгирской стоянки с людьми из другого известного палеолитического поселения – Костёнок на Среднем Дону (на территории Воронежской области). В Костёнках есть несколько стоянок, относящихся к верхнему палеолиту, раскапывают их с 1950-х годов и по сей день. Отдаленными родственниками сунгирских людей, по данным генетики, оказались молодой мужчина со стоянки Костёнки-14 и новорожденный со стоянки Костёнки-12, причем ближе всего к ним был новорожденный. Более отдаленное родство связывает сунгирцев и с обитателями верхнепалеолитической стоянки Дольни-Вестонице (Dolní Věstonice) на юге Чехии. В целом же на основании сравнения геномов сунгирских обитателей и их современников из других мест исследователи пришли к выводу, что люди верхнего палеолита избегали близкородственных браков. http://polit.ru/article/2017/11/03/ps_sunghir/

  8. #28
    Administrator Аватар для Noucost
    Регистрация
    04.02.2009
    Сообщений
    720
    Поблагодарил(а)
    56
    Получено благодарностей: 4 (сообщений: 4).

    «Денисовский человек» по мтДНК вдвое дальше от человека, чем неандерталец.

    Как выделяли ДНК из фаланги «денисовца»
    АНТРОПОГЕНЕЗ.РУ
    August 26, 2018

    Отправная точка палеогенетического исследования — мтДНК. Напомним, что каждая митохондрия нашей клетки имеет собственный геном. Этот геном весьма невелик по сравнению с ядерным (у человека — всего 16 565 пар нуклеотидов) и представлен множеством копий на клетку.


    Фаланга мизинца из Денисовой пещеры.
    По этому крошечному фрагменту и описали денисовцев
    Кроме того, поскольку митохондрии находятся в цитоплазме, человек получает свой митохондриальный геном из яйцеклетки — то есть от матери, без всякой примеси отцовских генов. Это удобно для построения родословных — как «чисто человеческих», так и межвидовых, благо у нас есть митохондриальные геномы неандертальцев, кроманьонцев и современных людей, а также обезьян. Кстати, дитя из Денисовой пещеры называют «X-woman» только потому, что исследовали его митохондриальную ДНК: «икс» — как нечто неизвестное, woman — в знак того, что полученные данные показывают наследование по женской линии. Определить пол ископаемого ребенка по мтДНК и форме косточки невозможно: необходим или более полный скелет, или ядерная ДНК.

    Для исследования выделили ДНК из 30 мг костного порошка. Изолированные фрагменты мтДНК секвенировали с обоих концов по технологии «Illumina». В дальнейший анализ включали только те фрагменты, которые удалось дочитать с двух концов до середины, с перекрыванием не менее чем на 11 пар нуклеотидов. Это заставило отказаться от всех фрагментов длиннее 134 п.н., зато уменьшило число ошибок на 3’-конце, где «Illumina» читает весьма неточно. Всего было получено 1 178 300 последовательностей, из которых в итоге лишь 30 443 использовали для восстановления мтДНК. Дело это тонкое: компьютерная программа должна «знать», какие повреждения характерны для древней ДНК. Если где-то имеет место расхождение в одну «букву», надо понимать, что считать правильным.

    Важнейшая проблема палеогенетики и палеогеномики — как не перепутать древнюю ДНК с более поздними загрязнениями. (Подробнее об этом см. «Химию и жизнь», 2009, № 5.) Полученную последовательность сравнивали не только с мтДНК неандертальцев и современных людей, но и с мтДНК животных, чтобы убедиться, что она человеческая. А чтобы доказать, что отсеквенирован был именно митохондриальный геном палеолитического ребенка, а не кого-то из соавторов работы, ДНК из костного материала выделили повторно и прочитали 9908 случайно выбранных фрагментов. Все они легли на полученную последовательность, а значит, результаты воспроизводились. Кроме того, проверили 276 позиций, в которых ДНК из Денисовой пещеры отличилась более чем от 99% современных людей, чтобы убедиться, что везде эти отличия одинаковы, то есть ДНК получена от одного индивида. (И действительно, они оказались одинаковыми в 99,7% случаев.)

    Удалось извлечь пользу даже из повреждений древней ДНК. При правильном подходе это своего рода «благородная патина», которая помогает отличить ДНК ископаемого существа от современных загрязнений. Например, еще на образцах неандертальцев было показано, что в обрывках подлинно древней ДНК у 5’-концов примерно треть цитозинов замещены тиминами, тогда как на 3-концах наблюдается комплементарное замещение гуанина аденином. Все это подтверждало: исследователи восстановили именно мтДНК ископаемого ребенка.

    Наконец, мтДНК из Денисовой пещеры сравнили с 54 образцами мтДНК современных людей, с мтДНК кроманьонца из позднего плейстоцена, найденного в Костёнках (Россия, Воронежская область), с шестью полными неандертальскими мтДНК, одной, полученной от бонобо, и одной от шимпанзе. О том, что было дальше, немецкий журнал «Шпигель» пишет в драматических тонах. «Иоганнес Краузе снова и снова перепроверял свои данные. Он никак не мог поверить в такой результат. Ученый хотел убедиться в своей правоте, прежде чем звонить боссу — знаменитому специалисту по эволюционной генетике Сванте Пээбо. Действительно ли ДНК получена от неизвестного прежде вида человека?» Пээбо, по его собственным словам, тоже был потрясен, когда ознакомился с результатами.

    Неандертальская мтДНК отличается от мтДНК современного человека в среднем по 202 позициям, ДНК «денисовского человека» — по 385 позициям, а шимпанзе — по 1462. (Как известно, мтДНК отдельных представителей Homo sapiens тоже различаются, но отличий в разы меньше, даже между далекими друг от друга этническими группами.) Таким образом, новая находка оказалась почти вдвое дальше от человека, чем неандерталец!

    Клещенко Е.В. Третий брат. Журнал «Химия и жизнь», 2010 г., №5, с. 3-4.
    https://telegra.ph/Kak-vydelyali-DNK...enisovca-08-26

Страница 3 из 3 ПерваяПервая 123

Ваши права

  • Вы не можете создавать новые темы
  • Вы не можете отвечать в темах
  • Вы не можете прикреплять вложения
  • Вы не можете редактировать свои сообщения
  •